Moderne Ansatze der Systembiologie basieren auf der Analyse und Modellierung von metabolischen Netzwerken im grossen Massstab. Derartige Modelle sind nur durch das Verweben von Daten aus verschiedenen Quellen erreichbar; beispielsweise Dateien im Systembiologie-Markup-Format (SBML) oder im Internet verfugbare Datenbanken. Die Zusammenfuhrung dieser Daten stellt uns vor grosse Herausforderungen, da oft wichtige Informationen in fur das menschliche Auge gedachten Texten versteckt sind. Teilweise sind Daten auch in Notations-Ebenen versteckt, die sich herkoemmlichen Verfahren nicht direkt erschliessen. In dieser Schrift wird unter anderem aufgezeigt, wie algebraische Analysen genutzt werden koennen um strukturelle Informationen freizulegen, die in den Massenwirkungsgesetzen von SBML-Dateien annotiert sind. Des weiteren wird der Organisationstheorie-Ansatz und dessen Anwendung fur die Detektion von Unschlussigkeiten in der Biomodels-Datenbank demonstriert. Ein Vergleich der Ergebnisse dieser Kombination von algebraischer Analyse und Organisationstheorie mit anderen Methoden wie der Fluss-Balance-Analyse (FBA) soll dann die Nutzlichkeit dieses Verfahrens belegen. Die damit zuganglich gemachten versteckten Daten zeigen, wie fehleranfallig wissenschafltiche Methoden sind, wenn die zu Grunde liegenden Daten fehlerbehaftet oder ungeeignet formatiert sind. Die Analyse der Biomodels-Datenbank, einer einfachen Sammlung von Modellen im SBML-Format, wird erganzt durch ein Programm, das entworfen wurde um bestimmte Bakteriengemeinschaften zu ergrunden: Diese Bakteriengemeinschaften sollen genutzt werden um auf biologischem Wege Altlasten zu vermindern. In dem entsprechenden Abschnitt dieser Arbeit werden die dafur notwendigen Voraussetzungen eroertert. Des weiteren wird auf die Schwierigkeiten eingegangen, die unweigerlich auftreten, wenn versucht wird eine automatisierte Loesung fur dieses Problem zu finden. Dabei werden problematische Datensatze eroertert, die auch bei anderen Ansatzen
